El sector hortofrutícola tiene, entre sus principales características, la obtención del 98% de sus rentas de la comercialización de sus productos en el mercado. Por ello la política comercial es prioritaria para FEPEX ya que la oferta importada afecta a los niveles de precios en los mercados comunitarios y en consecuencia a la renta del sector.

La Federación realiza un estricto seguimiento de las negociaciones de los acuerdos comerciales y de Asociación de la UE con terceros países con el fin de valorar su futura incidencia en los mercados, así como de las negociaciones en el marco de la Organización Mundial de Comercio.

Las actuaciones de FEPEX en política comercial se orientan a conseguir tres tipos de objetivos principalmente:

•  Mantener el principio de preferencia comunitaria, devaluado por la falta de control de las importaciones de países terceros.
  
  
•  Reequilibrar los diferentes niveles de protección en la UE a lo largo del año para que todas las producciones hortofrutícolas comunitarias tengan un nivel de protección similar.
  
  
•  La apertura de nuevos mercados para lo que es necesario que se eliminen las barreras fitosanitarios ficticias aplicadas por terceros países y que dificultan la exportación de frutas y hortalizas española.
  

Por otro lado, el régimen de intercambios comerciales erga omnes con Terceros Países en el sector de las frutas y hortalizas fue pactado en las negociaciones comerciales multilaterales de la Ronda Uruguay y está establecido en el Reglamento CE 3290/94 del Consejo. El régimen de intercambios aplicable al sector de las frutas y hortalizas está integrado por un sistema de certificados de importación, los tipos de los derechos del arancel aduanero común, el régimen de precios de entrada, las restituciones por exportación y las cláusulas de salvaguardia. La aplicación de estos mecanismos es también objeto de seguimiento por parte de FEPEX.